以前的学说，认为发酵现象与有机物或生物无关，路易斯的观察推翻了这种学说。
1857年，路易斯转任母校高等师范学校教席。里尔大学校长，对于大学的发展有很大贡献的能干的总务长说：“理科大学现在要失去一位第一流教授，同时也是学者的人了。”言下之意，对于路易斯的转任表示惋惜。
路易斯认为里尔大学已有相当的名声和地位，即使自己不在也会继续荣盛的。反观高等师范学校，却已今非昔比，经济上、学校事务、行政上以及优秀学生的培养等各方面都很不顺利。路易斯想：“我必须挽救我的母校。我要尽可能努力，恢复高等师范学校往日的盛誉。”他被委以全权负责学校事务、行政，并兼任理科主任。
从里尔迁移到巴黎的路易斯，计划边从事学校的工作，边做发酵的研究，可他找不到适合做研究室的房子，学校方面也不肯帮忙。
